Trên địa bàn tỉnh có 12 doanh nghiệp khoa học và công nghệ.

Một số cái tên quen thuộc với người dân như công ty cổ phần Nông nghiệp Chiềng Sung; Công ty cổ phần Cao nguyên Mộc Châu; Công ty cổ phần Greenfarm Mộc Châu; Hợp tác xã Hoa Mộc Châu; Hợp tác xã Dịch vụ, phát triển nông nghiệp 19/5 Mộc Châu; Công ty cổ phần Nafoods Tây Bắc…, bằng 91,7% tổng số doanh nghiệp khoa học và công nghệ trên địa bàn tỉnh.
Hiện nay, các hợp tác xã, doanh nghiệp khoa học và công nghệ sử dụng công nghệ cao (nhà lưới, nhà kính, hệ thống tưới tiết kiệm, kho lạnh, áp dụng quy trình sản xuất nông nghiệp tốt…) vào trong sản xuất, hoạt động có hiệu quả, tạo việc làm và thu nhập ổn định cho người lao động địa phương, chuyển giao các tiến bộ khoa học kỹ thuật cho tổ chức, cá nhân sản hoạt động trong lĩnh vực nông nghiệp. Diện tích cây trồng áp dụng quy trình sản xuất nông nghiệp tốt và các tiêu chuẩn tương đương đạt 2.838 ha; diện tích cà phê áp dụng 4C, UTZ: 14.600 ha. Sản lượng cá sản xuất áp dụng VietGAP hoặc GAP khác: 2.777 tấn/năm. Sản lượng mật ong sản xuất áp dụng VietGAP hoặc GAP khác: 364 nghìn lít/năm.